该实验室从2011年开始筹建，目前有研究人员1名（博士），研究方向有植物考古和寄生物考古。植物考古方向研究植物大遗存、淀粉粒、植硅石等植物微体化石；寄生物考古方向研究考古墓葬及特殊遗迹中的寄生物遗存。通过对考古遗存的分析，获得与古代人类食物来源、卫生健康、生业模式以及社会结构等方面相关的信息，作为传统田野考古研究方法的重要补充，为研究人类历史提供多方面的证据。已完成荥阳官庄、中牟大李庄、潢川黄国故城、浚县黎阳仓等5个遗址出土植物大遗存分析工作。目前植物考古方面初步建立现生植物种子标本库，拥有现生植物种子标本1000余种。